Le service de gestion comprend :

– la sous-direction des personnels administratifs et maritimes ;
– la sous-direction des personnels techniques, de recherche et contractuels ;
– le département de l'appui à la gestion des ressources humaines.

Le centre interministériel de gestion des ingénieurs des ponts, des eaux et des forêts, service à compétence nationale, est rattaché au chef de service.