Les élèves sont recrutés dans les cursus de formation initiale en 1re année :

1° Par voie d'une sélection dont les critères sont définis par l'ENSM et accessibles sur la plateforme nationale Parcoursup ;

2° Par la voie d'une sélection sur titre ou réorientation professionnelle selon les critères définis par l'ENSM ;

3° Par la voie d'une réorientation interne réservée aux élèves du cursus de formation des officiers de 1re classe de la marine marchande vers les filières monovalentes de l'ENSM. L'admission définitive des élèves réorientés des officiers de 1re classe de la marine marchande est prononcée par le directeur général de l'école.

Les élèves sont recrutés en 2^e année du premier cycle du cursus de formation pour l'obtention du diplôme d'élève officier de 1^re classe de la marine marchande et du diplôme d'études supérieures de la marine marchande par la voie d'une sélection sur dossier selon les critères définis par l'ENSM.

Les élèves de la spécialité génie maritime du cursus de formation initiale ingénieurs sont recrutés en 3^e année par la voie d'une sélection sur titre dont les critères sont fixés par l'ENSM ou par la voie du concours pour les étudiants issus des classes préparatoires aux grandes écoles, en spécialité physique-technologie.

Les élèves et apprentis de la spécialité génie maritime du cursus de formation initiale ingénieurs sont recrutés en 4^e année par la voie d'une sélection sur titre dont les critères sont fixés par l'ENSM. L'accès à la 4^e année est également proposé aux élèves ayant validé le premier cycle du cursus de formation d'officier de 1^re classe de la marine marchande/ ingénieur.