Les élèves sont recrutés dans les cursus de formation initiale en 1re année :
1° Par voie d'une sélection dont les critères sont définis par l'ENSM et accessibles sur la plateforme nationale Parcoursup ;
2° Par la voie d'une sélection sur titre ou réorientation professionnelle selon les critères définis par l'ENSM ;
3° Par la voie d'une réorientation interne réservée aux élèves du cursus de formation des officiers de 1re classe de la marine marchande vers les filières monovalentes de l'ENSM. L'admission définitive des élèves réorientés des officiers de 1re classe de la marine marchande est prononcée par le directeur général de l'école.