Le chef du service de l'inspection générale des affaires culturelles est le responsable de la mission ministérielle d'audit interne. Il peut déléguer cette fonction à un inspecteur général des affaires culturelles. Il assure en outre : ― la surveillance des conditions d'indépendance et d'objectivité des auditeurs ; ― le pilotage des actions de formation interne des auditeurs. Il établit toute relation utile avec les auditeurs externes du ministère. Le responsable de la mission ministérielle d'audit interne rend compte annuellement des travaux de la mission auprès du comité ministériel d'audit interne. Il est destinataire des comptes rendus du comité financier du ministère, des documents validés par le comité de maîtrise des risques et de toute autre instance en charge du contrôle interne dans les domaines autres que financier.

La mission ministérielle d'audit interne participe à l'élaboration de la politique d'audit interne du ministère en proposant un plan pluriannuel d'audit au vote du comité ministériel d'audit interne. Elle est ensuite chargée de sa mise en œuvre.