Le centre est soumis aux dispositions des titres Ier et IIIdu décret n° 2012-1246 du 7 novembre 2012 relatif àla gestion budgétaireet comptable publique, sous réserve des dispositions du décret n° 2002-252du 22 février 2002 relatif au régime budgétaire, financier et comptable des établissements publics à caractère scientifique et technologique. Des comptables secondaires peuvent être désignés par le président du centre après avis de l'agent comptable principal et avec l'agrément du ministre chargé du budget.

L'agent comptable de l'établissement est nommépar arrêté conjoint du ministre chargé de la recherche etdu ministre chargé du budget. Des comptables secondaires peuvent être désignés par le présidentdu centreaprès avis de l'agent comptable principal et avec l'agrément du ministre chargé du budget.