La direction générale de la performance économique et environnementale des entreprises comprend :

1. La délégation ministérielle aux entreprises agroalimentaires ;

2. La délégation ministérielle aux outre-mer ;

3. Le service « Développement des filières et de l'emploi » qui comprend :

- la sous-direction « Filières agroalimentaires » ;

- la sous-direction « Filières forêt-bois, cheval et bioéconomie » ;

4. Le service « Compétitivité et performance environnementale » qui comprend :

- la sous-direction « Compétitivité » ;

- la sous-direction « Performance environnementale et valorisation des territoires » ;

5. Le service « Europe et international » qui comprend :

- la sous-direction « Europe » ;

- la sous-direction « International » ;

6. Le service « Gouvernance et gestion de la politique agricole commune » qui comprend :

- la sous-direction « Gouvernance et pilotage » ;

- la sous-direction « Gestion des aides de la politique agricole commune ».