Le comité scientifique et pédagogique du centre de formation au management du ministère de la défense est présidé par un agent de l'Etat, désignée par le directeur des ressources humaines du ministère de la défense.
En cas d'absence ou d'empêchement du président, le directeur des ressources humaines du ministère de la défense préside ce comité.
Outre son président, le comité scientifique et pédagogique est composé de trois membres, désignés par le comité directeur en son sein.
Le mandat du président et des membres du comité scientifique et pédagogique est de trois ans renouvelables.
Le président peut inviter à participer au comité tout expert reconnu pour sa particulière implication dans l'un des domaines d'activité du centre.