La direction des affaires financières comprend :
1° Le service des synthèses et du pilotage budgétaire ;
2° La sous-direction de la prospective et de l'analyse des coûts ;
3° La sous-direction des questions économiques, fiscales et internationales ;
4° La sous-direction de la fonction financière et comptable ;
5° La sous-direction des référentiels et du système d'information financiers.
Dans ses domaines de compétences, la direction des affaires financières est, au ministère de la défense, l'interlocuteur exclusif des autres ministères, notamment le ministère chargé de l'économie et le ministère chargé du budget.