Liste des sites Natura 2000 désignés comme zones spéciales de conservation et zones de protection spéciale désignés en application de l'article L. 414-1 et inclus dans le périmètre d'intervention de l'établissement :

| | NOM DU SITE | NUMÉRO |DÉPARTEMENTS| |--------------|-----------------------------------------------------------|--------------|------------| | 1 | Marais poitevin |ZPS FR 5410100|17 - 79 - 85| |ZSC FR 5400446| 17 - 79 | | | |SIC FR 5200659| 85 | | | | 2 | Vallée de l'Autize |SIC FR 5400443| 79 | | 3 | Vallée du Magnerolles |ZSC FR 5400444| 79 | | 4 | Chaumes d'Avon |ZSC FR 5400445| 79 | | 5 | Plaines de Niort Nord-Ouest |ZPS FR 5412013| 79 - 85 | | 6 | Citerne de Saint-Ouenne |SIC FR 5402011| 79 | | 7 |Cavités à chiroptères de Saint-Michel-le-Cloucq et Pissotte|SIC FR 5202002| 85 | | 8 | Forêt de Mervent-Vouvant et ses abords |SIC FR 5200658| 85 | | 9 | Plaine calcaire du Sud-Vendée |ZPS FR 5212011| 85 |