Relèvent également du chef d'état-major des armées les organismes et autorités suivants, extérieurs à l'administration centrale :

• l'état-major interarmées de force et d'entraînement ;
• le commandement des opérations spéciales ;
• le centre national des sports de la défense ;
• des organismes de formation et d'enseignement militaire supérieur, des organismes logistiques, des organismes de guerre électronique, de télécommunication, de géographie, d'information et de commandement, dont la liste est fixée par instruction ;
• l'unité française de vérification ;
• les commandants supérieurs dans les départements d'outre-mer, en Polynésie française et en Nouvelle-Calédonie, et les commandants des forces françaises à l'étranger ainsi que leurs états-majors interarmées ;
• les officiers généraux de zone de défense.