Les communes situées dans le périmètre de l'établissement sont les suivantes :

Département de la Charente-Maritime

Nom et n° INSEE des communes dont le territoire est concerné en totalité par le périmètre :
Aigrefeuille-d'Aunis (17003), Anais (17007), Andilly (17008), Angliers (17009), Benon (17041), Bouhet (17057), Bourgneuf (17059), Charron (17091), Courçon (17127), Cramchaban (17132), Dœuil-sur-le-Mignon (17139), Esnandes (17153), Ferrières (17158), Forges (17166), La Grève-sur-le-Mignon (17182), Le Gué-d'Allère (17186), La Laigne (17201), Longèves (17208), Marans (17218), Marsilly (17222), Nuaille-d'Aunis (17267), Puyravault (17293), La Ronde (17303), Saint-Christophe (17315), Saint-Cyr-du-Doret (17322), Saint-Georges-du-Bois (17338), Saint-Jean-de-Liversay (17349), Saint-Médard-d'Aunis (17373), Saint-Ouen-d'Aunis (17376), Saint-Pierre-d'Amilly (17382), Saint-Sauveur-d'Aunis (17396), Sainte-Soulle (17407), Saint-Xandre (17414), Taugon (17439), Vérines (17466), Villedoux (17472), Virson (17480), Vouhé (17482).
Nom et n° INSEE des communes dont le territoire est concerné pour partie par le périmètre :
Chambon (17080), Croix-Chapeau (17136), Dompierre-sur-Mer (17142), La Jarrie (17194), Marsais (17221), Migre (17234), Montroy (17245), Père (17272), Saint-Félix (17327), Saint-Saturnin-du-Bois (17394), Saint-Séverin-sur-Boutonne (17401), Surgères (17434), Thaire (17443), Le Thou (17447), Villeneuve-la-Comtesse (17474).

Département des Deux-Sèvres

Nom et n° INSEE des communes dont le territoire est concerné en totalité par le périmètre :
Aiffres (79003), Aigonnay (79004), Amure (79009), Arçais (79010), Augé (79020), Avon (79023), Azay-le-Brûlé (79024), Beauvoir-sur-Niort (79031), Béceleuf (79032), Belleville (79033), Bessines (79034), Boisserolles (79039), La Boissière-en-Gâtine (79040), Bougon (79042), Le Bourdet (79046), La Crèche (79048), Le Busseau (79059), Champdeniers-Saint-Denis (79066), La Chapelle-Bâton (79070), Prissé-la-Charrière (79078), Chauray (79081), Chenay (79084), Cherveux (79086), Chey (79087), La Couarde (79098), Coulon (79100), Cours (79104), Echiré (79109), Epannes (79112), Exoudun (79115), Faye-sur-Ardin (79117), Fenioux (79119), Fors (79125), La Foye-Monjault (79127), François (79128), Fressines (79129), Frontenay-Rohan-Rohan (79130), Germond-Rouvre (79133), Granzay-Gript (79137), Les Groseillers (79139), Juscorps (79144), Magné (79162), Marigny (79166), Mauzé-sur-le-Mignon (79170), La Mothe-Saint-Héray (79184), Mougon (79185), Nanteuil (79189), Niort (79191), Pamplie (79200), Pamproux (79201), Pers (79205), Prahecq (79216), Prailles (79217), Priaires (79219), Prin-Deyrançon (79220), La Rochenard (79229), Romans (79231), Saint-Christophe-sur-Roc (79241), Saint-Coutant (79243), Sainte-Eanne (79246), Saint-Etienne-La-Cigogne (79247), Saint-Gelais (79249), Saint-Georges-de-Noisne (79253), Saint-Georges-de-Rex (79254), Saint-Hilaire-la-Palud (79257), Saint-Laurs (79263), Saint-Maixent-de-Beugné (79269), Saint-Maixent-l'Ecole (79270), Saint-Marc-la-Lande (79271), Saint-Martin-de-Bernegoue (79273), Saint-Martin-de-Saint-Maixent (79276), Saint-Maxire (79281), Sainte-Néomaye (79283), Sainte-Ouenne (79284), Saint-Paul-en-Gatine (79286), Saint-Pompain (79290), Saint-Rémy (79293), Sainte-Soline (79297), Saint-Symphorien (79298), Saivres (79302), Salles (79303), Sansais (79304), Sciecq (79308), Souvignê (79319), Surin (79320), Thorigné (79327), Thorigny (79328), Usseau (79334), Vallans (79335), Vançais (79336), Le Vanneau-Irleau (79337), Verruyes (79345), Villiers-en-Plaine (79351), Vouillé (79355), Xaintray (79357).
Nom et n° INSEE des communes dont le territoire est concerné pour partie par le périmètre :
Allonne (79007), Ardin (79012), Beaussais (79030), Le Beugnon (79035), Brûlain (79058), Celles-sur-Belle (79061), La Chapelle-Thireuil (79077), Chizé (79090), Clavé (79092), Coulonges-sur-l'Autize (79101), Exireuil (79114), Fomperron (79121), Les Fosses (79126), Lezay (79148), Mazières-en-Gâtine (79172), Puihardy (79223), Reffannes (79225), Le Retail (79226), Sainte-Blandine (79240), Saint-Lin (79267), Saint-Pardoux (79285), Saint-Romans-des-Champs (79294), Scillé (79309), Secondigny (79311), Sepvret (79313), Soudan (79316), Vernoux-en-Gatine (79342), Le Vert (79346), Villiers-en-Bois (79350), Vitré (79353), Vouhé (79354), Saint-Vincent-la-Châtre (79301).

Département de la Vendée

Nom et n° INSEE des communes dont le territoire est concerné en totalité par le périmètre :
L'Aiguillon-sur-Mer (85001), Angles (85004), Antigny (85005), Aubigny (85008), Auzay (85009), Bazoges-en-Pareds (85014), Benet (85020), Bessay (85023), Bouillé-Courdault (85028), Le Boupère (85031), Bourneau (85033), Bournezeau (85034), La Bretonnière-La-Claye (85036), Breuil-Barret (85037), La Caillère-Saint-Hilaire (85040), Cezais (85041), Chaillé-les-Marais (85042), Chaillé-sous-les-Ormeaux (85043), Chaix (85044), La Chaize-le-Vicomte (85046), Champagne-les-Marais (85049), Le Champ-Saint-Père (85050), Chantonnay (85051), La Chapelle-aux-Lys (85053), La Chapelle-Thémer (85056), Chasnais (85058), La Châtaigneraie (85059), Château-Guibert (85061), Chavagnes-les-Redoux (85066), Cheffois (85067), La Claye (85068), Les Clouzeaux (85069), Corpe (85073), La Couture (85074), Curzon (85077), Damvix (85078), Doix (85080), Faymoreau (85087), La Ferrière (85089), Fontaines (85091), Fontenay-le-Comte (85092), Fougeré (85093), Foussais-Payré (85094), Le Givre (85101), Grues (85104), Le Gué-de-Velluire (85105), l'Hermenault (85110), L'Ile-d'Elle (85111), La Jaudonnière (85115), La Jonchère (85116), Lairoux (85117), Le Langon (85121), Liez (85123), Loge-Fougereuse (85125), Longèves (85126), Longeville-sur-Mer (85127), Luçon (85128), Les Magnils-Reigniers (85131), Maille (85132), Maillezais (85133), Le Mazeau (85139), Mareuil-sur-Lay-Dissais (85135), Marillet (85136), Marsais-Sainte-Radégonde (85137), La Meilleraie-Tillay (85140), Mervent (85143), Monsireigne (85145), Montreuil (85148), Moreilles (85149), Mouilleron-en-Pareds (85154), Moutiers-sur-le-Lay (85157), Mouzeuil-Saint-Martin (85158), Nalliers (85159), Nesmy (85160), Nieul-sur-l'Autise (85162), L'Orbrie (85167), Oulmes (85168), Péault (85171), Petosse (85174), Les Pineaux (85175), Pissotte (85176), Le Poiré-sur-Velluire (85177), Pouillé (85181), Puy-de-Serre (85184), Puyravault (85185), Réaumur (85187), La Réorthe (85188), La Roche-sur-Yon (85191), Rochetrejoux (85192), Rosnay (85193), Saint-Aubin-la-Plaine (85199), Saint-Benoist-sur-Mer (85201), Saint-Cyr-des-Gâts (85205), Saint-Cyr-en-Talmondais (85206), Saint-Denis-du-Payré (85207), Saint-Etienne-de-Brillouet (85209), Saint-Florent-des-Bois (85213), Sainte-Gemme-la-Plaine (85216), Saint-Germain-de-Prinçay (85220), Saint-Germain-l'Aiguiller (85219), Saint-Hilaire-de-Voust (85229), Saint-Hilaire-le-Vouhis (85232), Saint-Jean-de-Beugné (85233), Saint-Juire-Champgillon (85235), Saint-Laurent-de-la-Salle (85237), Saint-Mars-la-Réorthe (85242), Saint-Martin-de-Fraigneau (85244), Saint-Martin-des-Fontaines (85245), Saint-Martin-Lars-en-Sainte-Hermine (85248), Saint-Maurice-des-Noues (85251), Saint-Maurice-le-Girard (85252), Saint-Michel-en-l'Herm (85255), Saint-Michel-le-Cloucq (85256), Saint-Paul-en-Pareds (85259), Saint-Pierre-le-Vieux (85265), Saint-Prouant (85266), Saint-Sigismond (85269), Saint-Valérien (85274), Saint-Vincent-Sterlanges (85276), Saint-Vincent-sur-Graon (85277), Sainte-Cécile (85202), Sainte-Hermine (85223), Saint-Hilaire-des-Loges (85227), Sainte-Pexine (85261), Sainte-Radégonde-des-Noyers (85267), Saint-Sulpice-en-Pareds (85271), Sérigné (85281), Sigournais (85282), Le Tablier (85285), Thallud-Sainte-Gemme (85287), La Taillée (85286), La Tardière (85289), Thiré (85290), Thorigny (85291), Thouarsais-Bouildroux (85292), La Tranche-sur-Mer (85294), Triaize (85297), Velluire (85299), Vix (85303), Vouillé-les-Marais (85304), Vouvant (85305), Xanton-Chassenon (85306), La Faute-sur-Mer (85307).
Nom et n° INSEE des communes dont le territoire est concerné pour partie par le périmètre :
Le Bernard (85022), La Boissière-des-Landes (85026), Dompierre-sur-Yon (85081), Les Epesses (85082), Les Essarts (85084), La Flocellière (85090), Menomblet (85141), La Merlatière (85142), Montournais (85147), Mouchamps (85153), Mouilleron-le-Captif (85155), Moutiers-les-Mauxfaits (85156), Nieul-le-Dolent (85161), L'Oie (85165), Le Poiré-sur-Vie (85178), Pouzauges (85182), Saint-Avaugourd-des-Landes (85200), Sainte-Florence (85212), Saint-Hilaire-des-Loges (85227), Saint-Martin-des Noyers (85246), Saint-Michel-Mont-Mercure (85257), Saint-Pierre-du-Chemin (85264), Venansoult (85300).

Département de la Vienne

Nom et n° INSEE des communes dont le territoire est concerné en totalité par le périmètre :
Rouillé (86213), Saint-Sauvant (86244).

Liste des masses d'eau souterraines rattachées aux sous-bassins d'alimentation en eau du Marais poitevin :
― nappe des calcaires et marnes captifs sous Flandrien du Lias et Dogger du Sud Vendée ;
― nappe des calcaires et marnes captifs sous Flandrien du jurassique supérieur de l'Aunis ;
― nappes du socle des bassins d'alimentation en eau du marais poitevin ;
― nappe du calcaire jurassique du bassin de Chantonnay ;
― nappe des calcaires et marnes du Lias et Dogger libre du Sud-Vendée ;
― nappe des calcaires et marnes du Lias-Dogger du bassin amont de la Sèvre-Niortaise ;
― nappe des calcaires et marnes libres du Jurassique supérieur de l'Aunis.

Liste des sites Natura 2000 désignés comme zones spéciales de conservation et zones de protection spéciale mentionnées en application de l'article L. 414-1 et inclus dans le périmètre d'intervention de l'établissement :

	NOM DU SITE	NUMÉRO	DÉPARTEMENTS
1	Marais poitevin	ZPS FR 5410100	17 ― 79 ― 85
		ZSC FR 5400446	17 ― 79
		SIC	85
2	Vallée de l'Autize	SIC FR 5400443	79
3	Vallée du Magnerolles	ZSC FR 5400444	79
4	Chaumes d'Avon	ZSC FR 5400445	79
5	Plaines de Niort Nord-Ouest	ZPS FR 5412013	79 ― 85
6	Citerne de Saint-Ouenne	SIC FR 5402011	79
7	Cavités à chiroptères de Saint-Michel-le-Cloucq et Pissotte	SIC FR 5202002	85
8	Forêt de Mervent ― Vouvant et ses abords	SIC FR 5200658	85
9	Plaine calcaire du Sud Vendée	ZPS FR 5212011	85