Le secrétaire général coordonne les réflexions stratégiques du ministère. Il veille à la cohérence des politiques ministérielles, s'assure de leur mise en oeuvre et coordonne l'action de l'ensemble des services de l'administration centrale. Il est haut fonctionnaire pour la modernisation et la déconcentration et met en oeuvre la stratégie ministérielle de réforme. Il est chargé de la gestion des personnels de direction.

Il préside le comité des directeurs.

Il élabore les priorités du ministère en matière internationale et coordonne les activités internationales et européennes du ministère.

Il élabore la stratégie de communication interne et externe du ministère et veille à sa mise en oeuvre.