Les espaces naturels protégés et, le cas échéant, les ports associés, les collectivités territoriales affectataires mentionnées au deuxième alinéa de l'article L. 321-12, les autres personnes publiques affectataires et les fractions qui leur sont affectées sont les suivants :
| DÉPARTEMENT D'IMPLANTATION | ESPACES NATURELS PROTÉGÉS
ET PORTS CONCERNÉS | PERSONNES PUBLIQUES BÉNÉFICIAIRES | PART AFFECTÉE|
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| 1. Parcs nationaux | | | |
| Guadeloupe | Parc national de la Guadeloupe : îlet Pigeon, îlets du Grand Cul de Sac marin, mangroves du Grand Cul de Sac marin classées en cœur de parc national ainsi que l'aire maritime adjacente | Etablissement public du parc national de la Guadeloupe | 100 % |
| Bouches-du-Rhône | Parc national des Calanques | Etablissement public du Parc national des Calanques | 100 % |
| 2. Réserves naturelles | | | |
| Gironde | Réserve naturelle nationale du Banc d'Arguin | Commune de La Teste-de-Buch | 100 % |
| Corse-du-Sud | Réserve naturelle nationale des bouches de Bonifacio | Office de l'environnement de la Corse | 100 % |
| Guadeloupe | Réserve naturelle nationale de Saint-Martin | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Réserve naturelle nationale de la Désirade et le port de la Désirade | Office national des forêts | 100 % | |
| Guyane | Réserve naturelle nationale de l'île du Grand-Connétable | Office français de la biodiversité | 100 % |
| Pyrénées-Orientales | Réserve naturelle nationale marine de Cerbère-Banyuls | Département des Pyrénées-Orientales | 100 % |
| La Réunion | Réserve naturelle nationale marine de La Réunion | Groupement d'intérêt public de la réserve naturelle marine de La Réunion| 100 % |
| 3. Sites naturels classés | | | |
| Côtes-d'Armor | Sites classés de l'île de Bréhat et port de Bréhat | Commune de l'île de Bréhat | 100 % |
| Finistère | Sites classés de l'île de Sein et port de l'île de Sein | Syndicat mixte du parc naturel régional d'Armorique | 100 % |
| Vendée | Sites classés de l'île d'Yeu (côte sauvage et bois de la Citadelle) | Commune de l'île d'Yeu | 100 % |
| Alpes-Maritimes | Sites classés des îles de Lérins : îles Sainte-Marguerite et Saint-Honorat | Office national des forêts | 100 % |
| Corse-du-Sud | Sites classés des îles Sanguinaires | Département de la Corse-du-Sud | 100 % |
| Guadeloupe | Sites classés du Pain de sucre et de la baie de Pompierre à Terre-de-Haut et port de Terre-de-Haut (archipel des Saintes) | Commune de Terre-de-Haut | 100 % |
| Sites classés des falaises nord-est de Marie-Galante et les ports de Marie-Galante | Communauté de communes du pays Marie-Galante | 100 % | |
| Pyrénées-Orientales | Sites classés du cap Oullestrell situés sur les communes de Banyuls-sur-Mer et Port-Vendres ainsi que le domaine public maritime correspondant | Département des Pyrénées-Orientales | 100 % |
| Sites classés du cap de l'Abeille | | | |
| Gironde | Sites classés de l'île aux oiseaux | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| 4. Sites naturels inscrits | | | |
| Morbihan | Ile d'Arz | Commune de l'île d'Arz | 100 % |
| Martinique | Ilet Madame | Commune du Robert | 100 % |
| 5. Terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | | | |
| Manche | Ile Tatihou | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Morbihan | Ile-aux-Moines du golfe du Morbihan | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Haute-Corse | Désert des Agriates et plage du Loto | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Guadeloupe | Iles de Petite-Terre | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Guyane | Iles du Salut | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Ille-et-Vilaine | Ile de Cézembre | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Mayotte | Ilots de Mayotte sauf M'Bouzi | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Gironde | Ile Nouvelle | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| 6. Espaces naturels bénéficiant de plusieurs protections | | | |
| Haute-Corse | Sites de la pointe du Cap Corse | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Corse-du-Sud | Espaces terrestres et marins classés de Porto et de Girolata et territoires classés de la réserve naturelle nationale de la presqu'île de Scandola | Syndicat mixte du parc naturel régional de Corse | 67 % |
| Commune d'Osani | 33 % | | |
| Espaces terrestres et marins classés et terrains du conservatoire situés sur les sites de Campumoru-Senetosa | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % | |
| Côtes-d'Armor | Espaces terrestres et marins classés en réserve naturelle nationale des Sept-Iles et terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres sur l'île aux Moines | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Finistère | Espaces terrestres et marins classés et terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres situés sur l'île de Batz | Commune de Batz | 50 % |
| Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 50 % | | |
| Espaces terrestres et marins classés, territoires classés de la réserve naturelle nationale d'Iroise situés dans l'archipel de Molène et port de Molène | Syndicat mixte du parc naturel régional d'Armorique | 100 % | |
| Espaces terrestres et marins classés, terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres situés sur les sites de l'île d'Ouessant et port de Lampaul | 100 % | | |
| Espaces terrestres et marins classés et territoires classés de la réserve naturelle nationale de Saint-Nicolas-de-Glénan situés sur l'archipel de Glénan, ainsi que le port de l'île de Saint-Nicolas| Département du Finistère | 100 % | |
| Morbihan | Espaces terrestres et marins classés, territoires classés de la réserve naturelle nationale François-le-Bail, port Tudy, port Lay, port Mélite et terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres situés sur l'île de Groix | Commune de Groix | 100 % |
| Espaces terrestres et marins classés, terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres situés sur Belle-Ile, ainsi que le port du Palais et le port de Sauzon | Communauté de communes de Belle-Ile-en-mer | 80 % | |
| Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 20 % | | |
| Espaces terrestres et marins classés, terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres situés sur l'île d'Hoedic, ainsi que le port de l'île d'Hoedic | Commune de Hoedic | 60 % | |
| Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 40 % | | |
| Espaces terrestres et marins classés, terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres situés sur l'île de Houat, ainsi que le port Saint-Gildas | Commune de Houat | 80 % | |
| Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 20 % | | |
| Charente-Maritime | Espaces terrestres et marins classés, terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres situés sur l'île d'Aix, ainsi que le port de la Rade | Commune de l'île d'Aix | 80 % |
| Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 20 % | | |
| Var | Parc national de Port-Cros :
-île de Port-Cros (dont le port de Port-Cros), île de Bagaud, île de la Gabinière, classés en cœur de parc national, ainsi que l'aire maritime adjacente ;
-espaces terrestres et maritimes situés sur l'île de Porquerolles et classés en cœur de parc national, en aire maritime adjacente (dont le port de Porquerolles) et en site classé| Etablissement public du parc national de Port-Cros | 100 % |
| Manche | Espaces terrestres classés et terrains du Conservatoire du littoral et des rivages lacustres situés sur l'archipel de Chausey | Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres | 100 % |
| Pyrénées-Orientales | Espaces terrestres et marins classés, terrains du Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres situés sur les sites du Cap Béar et ses abords | Département des Pyrénées-Orientales | 100 % |