La direction générale de l'enseignement et de la recherche comprend :

1. La sous-direction des politiques de formation et d'éducation ;

2. La sous-direction des établissements et de la politique contractuelle ;

3. La sous-direction de la recherche, de l'innovation, du développement et de la coopération internationale ;

4. La sous-direction de la stratégie en formation, recherche et développement ;

5. La mission des affaires générales ;

6. La mission de contrôle de gestion ;

7. La mission de l'information et de la communication.