La commission comprend, outre son président, les membres à voix délibérative suivants :
1° Le président de l'association régions de France ou son représentant ;
2° Le président de chambres d'agriculture France ou son représentant ;
3° Quatre personnalités représentant la production agricole choisies parmi les personnes proposées par les organisations syndicales d'exploitants agricoles représentatives mentionnées à l'article R. 514-39 ;
4° Une personnalité représentant la production du secteur de la pêche et de l'aquaculture, choisie parmi les personnes proposées par les organisations à compétence nationale les plus représentatives ;
5° Quatre personnalités représentant la production et la gestion forestière ;
6° Un représentant du comité stratégique de la filière bois ;
7° Trois représentants des instituts techniques agricoles, instituts techniques agro-industriels et centre technique industriel, choisis parmi les personnes proposées par ces organisations ;
8° Un représentant de la recherche et du conseil technique sur les thématiques des biodéchets et de la fertilisation ;
9° Deux personnalités représentant, pour l'une, le secteur coopératif, et pour l'autre, le secteur de l'industrie agro-alimentaire, choisies parmi les personnes proposées par les organisations à compétence nationale les plus représentatives ;
10° Quatre représentants des pôles de compétitivité actifs en matière de bioéconomie, choisis parmi les personnes proposées par ces pôles ;
11° Onze personnalités représentant les interprofessions reconnues les plus représentatives, choisies parmi les personnes proposées par ces organisations ;
12° Douze personnalités représentant des associations ou fédérations spécialisées en bioénergies, biomolécules, biomatériaux, biodéchets choisies parmi les personnes proposées par ces organisations ;
13° Quatre personnalités représentant des associations de protection de l'environnement choisies parmi les personnes proposées par ces associations ;
14° Deux représentants des associations nationales de consommateurs agréées ;
15° Cinq représentants d'établissements publics à voix consultative :

a) Le président du conseil d'administration de l'Agence de l'environnement et de la maîtrise de l'énergie ou son représentant ;
b) Le président-directeur général de l'Institut national de la recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement ou son représentant ;
c) Le président-directeur général de l'Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer ou son représentant ;
d) Le directeur général de l'Institut national de l'information géographique et forestière ou son représentant ;
e) Le président-directeur général de l'Office français de la biodiversité ou son représentant ;

16° Les présidents des groupes de travail institués en application de l'article 4.
La commission comprend dix représentants de l'Etat avec voix consultative :

a) Le directeur général de la performance économique et environnementale des entreprises au ministère chargé de l'agriculture ou son représentant ;
b) Le directeur général de l'enseignement et de la recherche au ministère chargé de l'agriculture ou son représentant ;
c) Le directeur des pêches maritimes et de l'aquaculture au ministère chargé de la pêche et de l'aquaculture ou son représentant ;
d) Le directeur général des douanes et droits indirects au midnistère chargé de l'économie ou son représentant ;
e) Le directeur général des entreprises au ministère chargé de l'économie ou son représentant ;
f) Le directeur général de l'énergie et du climat au ministère chargé de l'environnement ou son représentant ;
g) Le commissaire général du développement durable au ministère chargé de l'environnement ou son représentant ;
h) Le directeur général du Trésor au ministère chargé de l'économie ou son représentant ;
i) Le directeur général de l'aménagement, du logement et de la nature au ministère chargé de l'environnement ou son représentant ;
j) Le secrétaire général à la planification écologique ou son représentant.