Le préfet de la Côte-d'Or est désigné préfet coordonnateur du site Natura 2000 Gîtes et habitats à chauves-souris en Bourgogne (zone spéciale de conservation FR2601012), pour une durée de dix ans, dans les départements suivants :

- la Côte-d'Or ;
- la Nièvre ;
- la Saône-et-Loire.