Le préfet de la Côte-d'Or est désigné préfet coordonnateur du site Natura 2000 Cavités à chauves-souris en Bourgogne (zone spéciale de conservation FR2600975), pour une durée de dix ans, dans les départements suivants :

- la Côte-d'Or ;
- la Nièvre ;
- l'Yonne.