Le président de la commission de sécurité des systèmes d'information assure la représentation du haut fonctionnaire de défense dans les instances ministérielles et interministérielles traitant de la sécurité dans le domaine de l'information.
Dans le cas où d'autres autorités font l'objet d'une désignation particulière dans des instances interministérielles, ces autorités tiennent informé le président de la commission des travaux auxquels elles ont participé.