Le pôle qualité et méthodes exerce les missions du service relatives à la qualification des procédures du service ainsi qu'à la gestion des banques de données :

• il met en place la certification des procédures du service et s'assure de leur respect en période de fonctionnement ;
• il met à jour la documentation qualité du service ;
• il élabore et diffuse les documents méthodologiques et techniques nécessaires aux missions des services de prévision des crues ;
• il assure la gestion des bases de données du service, en particulier la banque HYDRO ;
• il assure la maintenance des réseaux informatiques et de communication ;
• il établit les préconisations pour garantir la cohérence nationale des outils de mesure et de modélisation.