Les secrétaires administratifs, affectés dans les services déconcentrés de l'administration pénitentiaire, reçoivent, dès leur prise de fonction, une formation d'adaptation.
Elle comprend des enseignements obligatoires dispensés à l'Ecole nationale d'administration pénitentiaire (ENAP) et des stages dans les autres services relevant de l'administration pénitentiaire.
Cette formation doit permettre, grâce à des enseignements théoriques et pratiques, l'intégration au sein de l'administration pénitentiaire et l'acquisition des compétences nécessaires à l'exercice des fonctions. Elle comporte l'initiation ou le renforcement d'un processus de professionnalisation ainsi que le développement d'une identité professionnelle de cadre, responsable d'une unité administrative.

L'ensemble des enseignements et des stages est d'une durée totale non fractionnable de six mois. En cas de changement ultérieur de fonction, une formation d'adaptation au poste doit être prévue dans l'année durant laquelle intervient celle-ci. Elle comprend le suivi de modules de formation liés aux techniques professionnelles en lien avec la nouvelle affectation. Ces actions de formation sont réalisées au sein des régions pénitentiaires.