Le secrétaire général assiste le directeur général dans la définition et la mise en œuvre de la politique de l'Office dans les domaines de la gestion administrative, logistique et financière de l'établissement.
Il est assisté d'un secrétaire général adjoint qui le supplée dans toutes ses attributions en cas d'absence ou d'empêchement.
Lui sont rattachés :
Des services centraux :

• le département des ressources humaines ;
• le département des finances ;
• le département de l'immobilier, des archives et des services communs ;
• le bureau des achats ;
• le bureau de l'informatique ;
• le chef de projet pour les restructurations ;
• le chef de projet pour l'entretien et rénovation des hauts lieux de la mémoire nationale et des sépultures de guerre ;
• le chef ou les chefs de projet d'assistance à maîtrise d'ouvrage.

Des services déconcentrés :

• le conseiller de prévention pour les hauts lieux de la mémoire nationale et les sépultures de guerre ;
• les secteurs d'entretien des sépultures de guerre.