En application des dispositions de l'article R. 213-49-9 du code de l'environnement, les associations agréées de protection de l'environnement représentées au conseil d'administration de l'Etablissement public du Marais poitevin sont :

― la Coordination de défense du Marais poitevin ;

― la Ligue pour la protection des oiseaux ;

― Pays de la Loire Nature Environnement ;

― Poitou-Charentes Nature (UCAPNE).