La direction centrale du service de santé des armées coordonne les besoins en matière d'effectifs, de soutien et de formation exprimés par les aumôniers en chef et les transmet au chef d'état-major des armées.
Elle assure une liaison permanente avec les commandants de formation administrative responsables du soutien des aumôniers militaires.
Elle gère les crédits alloués aux aumôneries et veille à la compatibilité de l'emploi des aumôniers militaires avec les moyens alloués.
Elle affecte les aumôniers militaires, sur proposition des aumôniers en chef.