Les agents contractuels de l'IRSTEA appartenant à la hors-catégorie sont classés soit dans le corps des chargés de recherche, soit dans celui des ingénieurs de recherche, conformément aux dispositions du tableau ci-après :
| CATÉGORIE D'ORIGINE | CORPS ET GRADE D'INTÉGRATION | ANCIENNETÉ DANS LE NOUVEL ÉCHELON |
| Agents contractuels hors catégorie de 1re classe | Chargés de recherche de 1re classe | |
| 5e échelon | 9e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 4e échelon | 9e échelon | Ancienneté acquise supprimée |
| 3e échelon | 7e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 2e échelon | 5e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 1er échelon | 4e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| Agents contractuels hors catégorie de classe normale | Chargés de recherche de 1re classe | |
| Echelon temporaire | 8e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 9e échelon | 7e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 8e échelon | 6e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 7e échelon | 6e échelon | Ancienneté acquise supprimée |
| 6e échelon | 5e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 5e échelon | 4e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 4e échelon | 4e échelon | Ancienneté acquise supprimée |
| 3e échelon | 3e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 2e échelon | 3e échelon | Ancienneté acquise supprimée |
| 1er échelon | 2e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| Agents contractuels hors catégorie de 1re classe | Ingénieurs de recherche de 1re classe | |
| 5e échelon | 5e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 4e échelon | 5e échelon | Ancienneté acquise supprimée |
| 3e échelon | 3e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 2e échelon | 2e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 1er échelon | 2e échelon | Ancienneté acquise supprimée |
| Agents contractuels hors catégorie de classe normale | Ingénieurs de recherche de 2e classe | |
| 9e échelon | Echelon temporaire Ancienneté acquise maintenue | |
| 8e échelon | 11e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 7e échelon | 10e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 6e échelon | 9e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 5e échelon | 8e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 4e échelon | 8e échelon | Ancienneté acquise supprimée |
| 3e échelon | 7e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 2e échelon | 6e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
| 1er échelon | 5e échelon | Ancienneté acquise maintenue |
Les décisions de classement sont prises compte tenu, d'une part, des fonctions qu'exercent les intéressés et du niveau ou de la nature des emplois qu'ils occupent et, d'autre part, des titres ou de la pratique professionnelle exigés pour accéder à cette catégorie et à cet échelon , après avis, pour chacun des corps d'accueil, d'une commission dont les membres sont nommés par le directeur général de l'IRSTEA. Cette commission comprend, en nombre égal, des représentants de l'administration, dont le directeur général de l'établissement président de la commission, et des représentants des personnels ayant vocation a être intégrés dans le corps d'accueil concerné des fonctionnaires de l'IRSTEA. Elle comprend, en outre, des experts extérieurs nommés après avis du conseil scientifique et technique, dans la limite de trois, au plus. Les représentants du personnel sont désignés sur proposition des organisations syndicales représentatives.