La caisse est administrée par un conseil d'administration de sept membres qui comprend :

Deux représentants du ministre des travaux publics et des transports.

Deux représentants du ministre des finances et des affaires économiques.

Un représentant du ministre de l'intérieur.

Le commissaire général du plan d'équipement et de la productivité ou son représentant, désigné à titre permanent.

Le directeur général de la caisse des dépôts et consignations ou son représentant, désigné à titre permanent.

Le président et le vice-président du conseil d'administration, choisis parmi les membres de celui-ci, sont désignés par arrêté du ministre des finances et des affaires économiques et du ministre des travaux publics et des transports.