Le comité comprend :

1° Le directeur de l'eau et de la biodiversité ou son représentant, qui en assure la présidence ;

2° Le directeur des infrastructures de transport ou son représentant ;

3° Le délégué interministériel à l'aménagement du territoire et à l'attractivité régionale ou son représentant ;

4° Le délégué général à l'outre-mer ou son représentant ;

5° Le directeur général des politiques agricole, agroalimentaire et des territoires ou son représentant ;

6° Le directeur du budget ou son représentant ;

7° Le président de l'Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ou son représentant ;

8° Le directeur général de l'Office national de la chasse et de la faune sauvage ou son représentant ;

9° Le directeur général du Muséum national d'histoire naturelle ou son représentant ;

10° Neuf membres du Comité national « trames verte et bleue » mentionné à l'article D. 371-3 du code de l'environnement dont :

a) Trois représentants désignés en son sein par le collège de représentants d'élus ;

b) Trois représentants désignés en son sein par le collège de représentants d'organismes socioprofessionnels, de propriétaires et d'usagers de la nature ;

c) Trois représentants désignés en son sein par le collège de représentants d'associations, d'organismes ou de fondations œuvrant pour la préservation de la biodiversité et de gestionnaires d'espaces naturels.