Les centres nationaux de référence pour la surveillance des maladies transmissibles sont de deux types :
1° Des laboratoires ayant pour mission :

• d'identifier les micro-organismes qui leur sont soumis par les laboratoires ;
• de conserver et entretenir des souches prototypes de bactéries, virus ou autres agents pathogènes ;
• de détenir des antisérums de référence ;
• de contribuer à la surveillance épidémiologique de la ou des pathologies dues aux micro-organismes dont ils assurent le diagnostic.

2° Des centres de surveillance épidémiologique ayant pour mission, selon des programmes définis en liaison avec le ministère chargé de la santé :

• de recueillir et analyser les cas d'une ou de plusieurs pathologies infectieuses définies ;
• de surveiller la couverture immunitaire d'une population, générale ou particulière, protégée par un ou plusieurs vaccins.