Ces commissions ont compétence dans les domaines d'activité suivants :

- commission interdisciplinaire 50 : Gestion de la recherche ;
- commission interdisciplinaire 51 : Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant ;
- commission interdisciplinaire 52 : Socio-écosystèmes et changements environnementaux globaux : enjeux, savoirs, méthodologies ;
- commission interdisciplinaire 53 : Humains, sociétés, technologies matérielles et numériques ;
- commission interdisciplinaire 54 : Sciences et données.