La sous-direction des affaires financières est chargée :

- d'élaborer la programmation des ressources financières du service et leur répartition ;

- d'assurer l'exécution du budget du service et le suivi des dépenses d'autres organismes dont le ministre lui confie la gestion, et notamment :

des organismes interarmées ;

des participations du ministère aux organismes militaires internationaux ;

des crédits consacrés à l'assistance aux armées étrangères séjournant sur le territoire national ;

d'élaborer et de notifier les marchés publics ;

de définir et de tenir à jour les indicateurs permettant de rendre compte de la réalisation des objectifs assignés au service et de développer les outils d'analyse permettant d'élaborer une comptabilité analytique ;

d'assurer, au profit du service, le rôle de correspondant unique des autorités de contrôle.

Le sous-directeur des affaires financières dispose de la régie d'avances et de recettes.