Le siège de la direction interdépartementale des routes Centre-Est est implanté à Lyon (Rhône). Son ressort territorial est constitué des sections de routes nationales et d'autoroutes décrites dans le présent article et s'étendant sur les départements de l'Allier, de l'Ardèche, de l'Aube, de la Côte-d'Or, de la Drôme, de l'Isère, de la Loire, de la Nièvre, du Rhône, de la Saône-et-Loire, de la Savoie, de la Haute-Savoie, de Vaucluse et de l'Yonne.
- Section 1 : l'autoroute A 6 (située dans le département du Rhône) entre la section concédée de cette même autoroute commençant à Dardilly et l'entrée nord du tunnel sous Fourvière à Lyon.
- Section 2 : l'autoroute A 6 (située dans le département du Rhône) à Lyon entre l'entrée sud du tunnel sous Fourvière et son prolongement par l'autoroute A 7.
- Section 3 : l'autoroute A 7 (située dans le département du Rhône) entre son prolongement par l'autoroute A 6 à Lyon et la section concédée de l'autoroute A 7 commençant à Ternay.
- Section 4 : la route nationale 346 (située dans le département du Rhône) entre son prolongement par l'autoroute A 46 sud à Saint-Priest et son prolongement par l'autoroute A 46 nord à Vaulx-en-Velin.
- Section 5 : l'autoroute A 42 (située dans le département du Rhône) entre l'échangeur avec le boulevard périphérique de Lyon à Villeurbanne et l'échangeur avec la route nationale 346 à Vaulx-en-Velin.
- Section 6 : l'autoroute A 43 (située dans le département du Rhône) entre la limite de concession de cette même autoroute commençant à Bron et l'avenue Mermoz à Lyon.
- Section 7 : l'autoroute A 450 (située dans le département du Rhône) entre l'échangeur avec l'autoroute A 7 à Pierre-Bénite et le croisement avec la route départementale 486 à Brignais.
- Section 8 : l'autoroute A 47 (située dans les départements du Rhône et de la Loire) entre l'échangeur avec l'autoroute A 7 à Ternay et son prolongement par la route nationale 88 à Saint-Chamond.
- Section 9 : l'autoroute A 72 (située dans le département de la Loire) entre la section concédée de cette même autoroute commençant à Andrézieux-Bouthéon et l'échangeur avec la route nationale 88 à Saint-Etienne.
- Section 10 : la route nationale 88 (située dans le département de la Loire) entre son prolongement par l'autoroute A 47 à Saint-Chamond et la limite entre les départements de la Loire et de la Haute-Loire.
- Section 11 : la route nationale 488 (située dans le département de la Loire) à Saint-Etienne entre l'échangeur avec la route nationale 88 et le croisement avec la rue de la Montat.
- Section 12 : la route nationale 7 (située dans les départements du Rhône, de l'Isère, de la Drôme et de Vaucluse) entre l'échangeur avec l'autoroute A 46 sud à Communay et le croisement avec la route départementale 63 à Lapalud.
- Section 13 : la route nationale 102 (située dans les départements de la Drôme et de l'Ardèche) entre le croisement avec la route nationale 7 à Montélimar et son prolongement par la route nationale 86 au Teil.
- Section 14 : la route nationale 86 (située dans le département de l'Ardèche) au Teil entre son prolongement par la route nationale 102 au nord et son prolongement par la route nationale 102 au sud.
- Section 15 : la route nationale 102 (située dans le département de l'Ardèche) entre son prolongement par la route nationale 86 au Teil et le croisement avec la route départementale 107 à Alba-la-Romaine.
- Section 16 : la route nationale 532 (située dans le département de la Drôme) entre le croisement avec la route nationale 7 à Valence et son prolongement par l'autoroute A 49 à Bourg-de-Péage.
- Section 17 : l'autoroute A 77 (située dans le département de la Nièvre) entre la section concédée de cette même autoroute commençant à Cosne-sur-Loire et son prolongement par la route nationale 7 à Pouilly-sur-Loire.
- Section 18 : la route nationale 7 (située dans le département de la Nièvre) entre son prolongement par l'autoroute A 77 à Pouilly-sur-Loire et son prolongement par l'autoroute A 77 à Pougues-les-Eaux.
- Section 19 : l'autoroute A 77 (située dans le département de la Nièvre) entre son prolongement par la route nationale 7 à Pougues-les-Eaux et son prolongement par la route nationale 7 à Sermoise-sur-Loire.
- Section 20 : la route nationale 7 (située dans les départements de la Nièvre, de l'Allier, de la Loire et du Rhône) entre son prolongement par l'autoroute A 77 à Sermoise-sur-Loire et le croisement avec la route nationale 489 à la Tour-de-Salvagny.
- Section 21 : la route nationale 209 (située dans le département de l'Allier) entre le croisement avec la route nationale 7 à Varennes-sur-Allier et le croisement avec la route départementale 67 à Creuzier-le-Neuf.
- Section 22 : la route nationale 82 (située dans le département de la Loire) entre le croisement avec la route nationale 7 à L'Hôpital-sur-Rhins et le croisement avec l'antenne autoroutière de l'autoroute A 72 à Balbigny.
- Section 23 : la route nationale 6 (située dans le département du Rhône) à Dardilly entre le croisement avec la route nationale 489 et l'échangeur avec l'autoroute A 6.
- Section 24 : la route nationale 489 (située dans le département du Rhône) entre le croisement avec la route nationale 6 à Dardilly et le croisement avec la route nationale 7 à La Tour-de-Salvagny.
- Section 25 : la route nationale 77 (située dans les départements de l'Aube et de l'Yonne) entre le croisement avec la rocade ouest de Troyes à Saint-André-les-Vergers et le croisement avec la route nationale 151 à Auxerre.
- Section 26 : la route nationale 6 (située dans le département de l'Yonne) entre l'échangeur avec l'autoroute A 6 à Monéteau et le croisement avec la route nationale 65 à Auxerre.
- Section 27 : la route nationale 65 (située dans le département de l'Yonne) entre le croisement avec la route nationale 6 à Auxerre et l'échangeur avec l'autoroute A 6 à Venoy.
- Section 28 : la route nationale 151 (située dans les départements de l'Yonne et de la Nièvre) entre le croisement avec la route nationale 77 à Auxerre et la limite entre les départements de la Nièvre et du Cher.
- Section 29 : la route nationale 79 (située dans les départements de l'Allier et de Saône-et-Loire) entre l'échangeur avec l'autoroute A 71 à Montmarault et l'échangeur avec l'autoroute A 6 à Varennes-lès-Mâcon.
- Section 30 : la route nationale 70 (située dans le département de Saône-et-Loire) entre l'échangeur avec la route nationale 79 à Paray-le-Monial et le croisement avec la route nationale 80 à Montchanin.
- Section 31 : la route nationale 80 (située dans le département de Saône-et-Loire) entre le croisement avec la route nationale 79 à Montchanin et le croisement avec la route nationale 6 à Saint-Rémy.
- Section 32 : l'autoroute A 38 (située dans le département de la Côte-d'Or) entre l'échangeur avec l'autoroute A 6 à Pouilly-en-Auxois et l'échangeur avec la route nationale 5 à Plombières-lès-Dijon.
- Section 33 : la route nationale 274 (située dans le département de la Côte-d'Or) à Dijon entre son prolongement par l'autoroute A 311 et le croisement avec la route nationale 74.
- Section 34 : la route nationale 205 (située dans le département de la Haute-Savoie) entre son prolongement par l'autoroute A 40 à Passy et l'échangeur de la Vigie avec la route nationale 506 à Chamonix-Mont-Blanc.
- Section 35 : la route nationale 201 (située dans le département de la Savoie) entre le croisement de Villarcher à Voglans et son prolongement par l'autoroute A 41 à La Ravoire.
- Section 36 : la route nationale 90 (située dans le département de la Savoie) entre son prolongement par l'autoroute A 430 à Gilly-sur-Isère et l'entrée de Bourg-Saint-Maurice.
- Section 37 : l'autoroute A 48 (située dans le département de l'Isère) entre la section concédée de cette même autoroute commençant à Saint-Egrève et son extrémité à Grenoble.
- Section 38 : la route nationale 87 (située dans le département de l'Isère) entre l'échangeur avec l'autoroute A 480 à Echirolles et l'échangeur avec l'autoroute A 41 à Meylan.
- Section 39 : l'autoroute A 480 (située dans le département de l'Isère) entre l'échangeur avec l'autoroute A 48 à Saint-Egrève et l'échangeur avec l'autoroute A 51 à Varces.
- Section 40 : la route nationale 85 (située dans le département de l'Isère) entre l'échangeur avec l'autoroute A 480 à Pont-de-Claix et le croisement avec la route départementale 5 à Vizille.