Ces commissions ont compétence dans les domaines d'activité suivants :

- commission interdisciplinaire 50 : gestion de la recherche ;
- commission interdisciplinaire 51 : modélisation et analyse des données et des systèmes biologiques : approches informatiques, mathématiques et physiques ;
- commission interdisciplinaire 52 : environnements sociétés : du fondamental à l'opérationnel ;
- commission interdisciplinaire 53 : méthodes, pratiques et communications des sciences et des techniques ;
- commission interdisciplinaire 54 : méthodes expérimentales, concepts et instrumentation en sciences de la matière et en ingénierie pour le vivant.