La direction générale de la santé comprend :
1° Quatre sous-directions chargées des politiques de santé, dénommées respectivement :
a) Sous-direction de la politique des pratiques et des produits de santé ;
b) Sous-direction de la promotion de la santé et de la prévention des maladies chroniques ;
c) Sous-direction de la prévention des risques infectieux ;
d) Sous-direction de la prévention des risques liés à l'environnement et à l'alimentation ;
2° Un service chargé de l'appui au pilotage et du soutien des politiques de santé, dénommé secrétariat général.
Sont en outre rattachés au directeur général : un cabinet, un département des urgences sanitaires, une mission de l'analyse stratégique, de la prospective, de la recherche et de l'appui scientifique, une mission de la qualité et du management, une mission des affaires européennes et internationales et une mission de l'information et de la communication.